Protein–RNA interactions for Protein: Q12765

SCRN1, Secernin-1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN1Q12765 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SCRN1Q12765 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms