Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM27E3Q08E93 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms