Protein–RNA interactions for Protein: Q08881

ITK, Tyrosine-protein kinase ITK/TSK, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITKQ08881 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITKQ08881 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITKQ08881 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ITKQ08881 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITKQ08881 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITKQ08881 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITKQ08881 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITKQ08881 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITKQ08881 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITKQ08881 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITKQ08881 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITKQ08881 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITKQ08881 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITKQ08881 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITKQ08881 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITKQ08881 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITKQ08881 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITKQ08881 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITKQ08881 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITKQ08881 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITKQ08881 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITKQ08881 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITKQ08881 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITKQ08881 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITKQ08881 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITKQ08881 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITKQ08881 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITKQ08881 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITKQ08881 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITKQ08881 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITKQ08881 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITKQ08881 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ITKQ08881 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITKQ08881 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ITKQ08881 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITKQ08881 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITKQ08881 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITKQ08881 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITKQ08881 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITKQ08881 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITKQ08881 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITKQ08881 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITKQ08881 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ITKQ08881 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITKQ08881 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITKQ08881 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITKQ08881 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITKQ08881 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITKQ08881 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITKQ08881 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITKQ08881 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITKQ08881 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITKQ08881 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITKQ08881 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITKQ08881 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITKQ08881 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITKQ08881 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITKQ08881 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITKQ08881 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITKQ08881 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITKQ08881 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITKQ08881 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITKQ08881 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITKQ08881 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITKQ08881 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITKQ08881 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITKQ08881 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITKQ08881 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITKQ08881 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITKQ08881 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITKQ08881 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITKQ08881 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITKQ08881 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITKQ08881 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITKQ08881 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITKQ08881 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITKQ08881 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITKQ08881 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITKQ08881 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITKQ08881 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITKQ08881 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITKQ08881 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITKQ08881 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITKQ08881 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITKQ08881 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITKQ08881 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITKQ08881 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITKQ08881 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITKQ08881 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITKQ08881 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITKQ08881 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITKQ08881 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITKQ08881 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITKQ08881 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITKQ08881 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITKQ08881 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITKQ08881 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITKQ08881 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITKQ08881 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITKQ08881 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms