Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms