Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms