Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms