Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB1Q02818 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms