Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRCDQ00LT1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms