Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5Q00535 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms