Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2BQ00403 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2BQ00403 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms