Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSBP2P81877 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP2P81877 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP2P81877 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP2P81877 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP2P81877 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP2P81877 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP2P81877 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP2P81877 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP2P81877 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP2P81877 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP2P81877 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP2P81877 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP2P81877 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP2P81877 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSBP2P81877 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSBP2P81877 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP2P81877 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP2P81877 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP2P81877 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP2P81877 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP2P81877 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms