Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRX1P78414 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRX1P78414 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRX1P78414 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRX1P78414 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRX1P78414 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRX1P78414 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRX1P78414 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRX1P78414 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRX1P78414 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
IRX1P78414 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRX1P78414 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRX1P78414 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRX1P78414 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRX1P78414 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRX1P78414 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRX1P78414 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRX1P78414 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
IRX1P78414 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRX1P78414 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRX1P78414 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRX1P78414 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRX1P78414 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRX1P78414 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRX1P78414 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRX1P78414 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRX1P78414 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRX1P78414 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRX1P78414 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRX1P78414 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRX1P78414 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRX1P78414 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRX1P78414 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRX1P78414 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRX1P78414 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRX1P78414 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IRX1P78414 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRX1P78414 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IRX1P78414 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRX1P78414 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRX1P78414 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRX1P78414 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IRX1P78414 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRX1P78414 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRX1P78414 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRX1P78414 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRX1P78414 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRX1P78414 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRX1P78414 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRX1P78414 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRX1P78414 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRX1P78414 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRX1P78414 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRX1P78414 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRX1P78414 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRX1P78414 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRX1P78414 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRX1P78414 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRX1P78414 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRX1P78414 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRX1P78414 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRX1P78414 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRX1P78414 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms