Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB4BP68371 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms