Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms