Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS29P62273 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS29P62273 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS29P62273 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS29P62273 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS29P62273 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS29P62273 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS29P62273 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS29P62273 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS29P62273 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS29P62273 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS29P62273 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS29P62273 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS29P62273 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS29P62273 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS29P62273 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS29P62273 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS29P62273 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS29P62273 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS29P62273 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS29P62273 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS29P62273 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS29P62273 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS29P62273 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS29P62273 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS29P62273 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS29P62273 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS29P62273 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS29P62273 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS29P62273 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS29P62273 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS29P62273 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS29P62273 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS29P62273 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS29P62273 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS29P62273 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS29P62273 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS29P62273 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS29P62273 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS29P62273 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS29P62273 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS29P62273 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS29P62273 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS29P62273 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS29P62273 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS29P62273 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS29P62273 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS29P62273 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS29P62273 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS29P62273 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS29P62273 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS29P62273 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS29P62273 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS29P62273 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS29P62273 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS29P62273 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS29P62273 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS29P62273 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS29P62273 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS29P62273 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS29P62273 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS29P62273 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS29P62273 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS29P62273 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS29P62273 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS29P62273 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RPS29P62273 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RPS29P62273 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
RPS29P62273 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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