Protein–RNA interactions for Protein: P61587

RND3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND3P61587 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RND3P61587 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RND3P61587 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RND3P61587 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RND3P61587 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RND3P61587 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RND3P61587 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RND3P61587 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RND3P61587 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RND3P61587 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RND3P61587 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RND3P61587 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RND3P61587 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RND3P61587 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RND3P61587 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RND3P61587 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RND3P61587 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RND3P61587 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RND3P61587 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RND3P61587 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RND3P61587 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RND3P61587 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RND3P61587 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RND3P61587 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RND3P61587 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RND3P61587 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RND3P61587 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RND3P61587 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RND3P61587 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RND3P61587 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RND3P61587 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RND3P61587 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RND3P61587 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RND3P61587 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RND3P61587 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RND3P61587 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RND3P61587 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RND3P61587 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RND3P61587 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RND3P61587 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RND3P61587 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RND3P61587 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RND3P61587 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RND3P61587 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RND3P61587 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RND3P61587 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RND3P61587 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RND3P61587 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RND3P61587 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RND3P61587 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RND3P61587 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RND3P61587 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RND3P61587 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RND3P61587 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RND3P61587 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RND3P61587 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RND3P61587 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RND3P61587 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RND3P61587 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RND3P61587 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RND3P61587 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RND3P61587 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms