Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms