Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms