Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms