Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms