Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms