Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms