Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms