Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms