Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCAMP43121 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCAMP43121 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCAMP43121 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCAMP43121 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCAMP43121 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCAMP43121 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCAMP43121 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCAMP43121 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCAMP43121 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCAMP43121 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MCAMP43121 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCAMP43121 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCAMP43121 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCAMP43121 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCAMP43121 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCAMP43121 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCAMP43121 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCAMP43121 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCAMP43121 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCAMP43121 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MCAMP43121 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCAMP43121 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MCAMP43121 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCAMP43121 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MCAMP43121 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCAMP43121 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCAMP43121 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCAMP43121 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCAMP43121 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCAMP43121 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCAMP43121 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCAMP43121 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCAMP43121 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCAMP43121 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCAMP43121 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCAMP43121 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCAMP43121 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCAMP43121 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCAMP43121 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCAMP43121 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCAMP43121 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCAMP43121 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCAMP43121 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCAMP43121 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCAMP43121 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCAMP43121 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCAMP43121 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCAMP43121 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCAMP43121 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCAMP43121 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCAMP43121 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCAMP43121 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCAMP43121 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCAMP43121 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCAMP43121 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCAMP43121 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCAMP43121 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCAMP43121 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCAMP43121 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCAMP43121 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MCAMP43121 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCAMP43121 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCAMP43121 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCAMP43121 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCAMP43121 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCAMP43121 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCAMP43121 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MCAMP43121 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCAMP43121 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCAMP43121 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCAMP43121 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCAMP43121 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCAMP43121 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCAMP43121 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCAMP43121 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCAMP43121 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCAMP43121 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCAMP43121 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCAMP43121 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCAMP43121 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCAMP43121 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCAMP43121 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MCAMP43121 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCAMP43121 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCAMP43121 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCAMP43121 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MCAMP43121 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCAMP43121 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MCAMP43121 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCAMP43121 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCAMP43121 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCAMP43121 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCAMP43121 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCAMP43121 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCAMP43121 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCAMP43121 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCAMP43121 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCAMP43121 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCAMP43121 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms