Protein–RNA interactions for Protein: P40199

CEACAM6, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM6P40199 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms