Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIPAP38571 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIPAP38571 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIPAP38571 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPAP38571 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPAP38571 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPAP38571 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPAP38571 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPAP38571 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPAP38571 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPAP38571 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPAP38571 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPAP38571 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPAP38571 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPAP38571 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPAP38571 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPAP38571 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPAP38571 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPAP38571 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPAP38571 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPAP38571 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPAP38571 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPAP38571 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPAP38571 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPAP38571 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPAP38571 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPAP38571 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPAP38571 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPAP38571 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPAP38571 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPAP38571 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPAP38571 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPAP38571 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPAP38571 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPAP38571 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LIPAP38571 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
LIPAP38571 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LIPAP38571 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPAP38571 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPAP38571 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPAP38571 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPAP38571 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPAP38571 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPAP38571 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPAP38571 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPAP38571 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPAP38571 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPAP38571 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPAP38571 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPAP38571 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPAP38571 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPAP38571 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPAP38571 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPAP38571 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPAP38571 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPAP38571 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPAP38571 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPAP38571 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPAP38571 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPAP38571 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPAP38571 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LIPAP38571 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms