Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms