Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP7BP35670 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms