Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPA3P35244 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA3P35244 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA3P35244 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA3P35244 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA3P35244 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA3P35244 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA3P35244 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA3P35244 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA3P35244 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA3P35244 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA3P35244 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA3P35244 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA3P35244 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA3P35244 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA3P35244 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA3P35244 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA3P35244 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA3P35244 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA3P35244 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA3P35244 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA3P35244 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA3P35244 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA3P35244 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA3P35244 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA3P35244 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA3P35244 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA3P35244 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA3P35244 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA3P35244 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA3P35244 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA3P35244 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA3P35244 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA3P35244 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA3P35244 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA3P35244 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA3P35244 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA3P35244 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA3P35244 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA3P35244 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA3P35244 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA3P35244 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA3P35244 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA3P35244 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA3P35244 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA3P35244 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA3P35244 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA3P35244 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA3P35244 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA3P35244 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPA3P35244 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA3P35244 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA3P35244 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA3P35244 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA3P35244 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA3P35244 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA3P35244 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA3P35244 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA3P35244 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA3P35244 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA3P35244 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA3P35244 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA3P35244 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA3P35244 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA3P35244 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA3P35244 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA3P35244 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA3P35244 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA3P35244 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPA3P35244 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA3P35244 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA3P35244 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA3P35244 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA3P35244 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA3P35244 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA3P35244 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA3P35244 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA3P35244 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA3P35244 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA3P35244 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA3P35244 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA3P35244 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA3P35244 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA3P35244 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA3P35244 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA3P35244 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA3P35244 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA3P35244 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA3P35244 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA3P35244 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA3P35244 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA3P35244 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA3P35244 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA3P35244 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA3P35244 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA3P35244 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA3P35244 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA3P35244 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA3P35244 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RPA3P35244 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms