Protein–RNA interactions for Protein: P34932

HSPA4, Heat shock 70 kDa protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4P34932 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
HSPA4P34932 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms