Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL9P32969 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL9P32969 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL9P32969 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL9P32969 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL9P32969 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL9P32969 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL9P32969 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL9P32969 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL9P32969 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL9P32969 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL9P32969 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL9P32969 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL9P32969 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL9P32969 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL9P32969 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL9P32969 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL9P32969 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL9P32969 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL9P32969 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL9P32969 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL9P32969 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL9P32969 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL9P32969 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL9P32969 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL9P32969 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL9P32969 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL9P32969 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL9P32969 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL9P32969 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL9P32969 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL9P32969 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL9P32969 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL9P32969 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL9P32969 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL9P32969 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL9P32969 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL9P32969 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL9P32969 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL9P32969 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL9P32969 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL9P32969 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL9P32969 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL9P32969 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL9P32969 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL9P32969 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL9P32969 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL9P32969 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL9P32969 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL9P32969 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL9P32969 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL9P32969 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL9P32969 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL9P32969 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL9P32969 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL9P32969 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL9P32969 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL9P32969 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL9P32969 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL9P32969 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL9P32969 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL9P32969 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL9P32969 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL9P32969 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL9P32969 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL9P32969 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL9P32969 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL9P32969 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL9P32969 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL9P32969 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL9P32969 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL9P32969 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL9P32969 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL9P32969 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL9P32969 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL9P32969 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL9P32969 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL9P32969 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL9P32969 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL9P32969 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL9P32969 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL9P32969 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL9P32969 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL9P32969 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL9P32969 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL9P32969 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL9P32969 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL9P32969 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL9P32969 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL9P32969 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL9P32969 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL9P32969 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL9P32969 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL9P32969 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL9P32969 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL9P32969 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL9P32969 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL9P32969 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL9P32969 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL9P32969 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms