Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG3P32926 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG3P32926 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG3P32926 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG3P32926 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG3P32926 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG3P32926 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG3P32926 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG3P32926 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG3P32926 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG3P32926 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG3P32926 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG3P32926 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG3P32926 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG3P32926 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG3P32926 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG3P32926 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG3P32926 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG3P32926 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG3P32926 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG3P32926 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG3P32926 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG3P32926 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG3P32926 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG3P32926 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG3P32926 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG3P32926 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG3P32926 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG3P32926 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG3P32926 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG3P32926 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG3P32926 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG3P32926 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG3P32926 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG3P32926 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG3P32926 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG3P32926 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG3P32926 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG3P32926 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG3P32926 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG3P32926 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG3P32926 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG3P32926 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG3P32926 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG3P32926 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG3P32926 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG3P32926 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG3P32926 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG3P32926 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG3P32926 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSG3P32926 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSG3P32926 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSG3P32926 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSG3P32926 RNF139-AS1-202ENST00000519861 359 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSG3P32926 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSG3P32926 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSG3P32926 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSG3P32926 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DSG3P32926 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSG3P32926 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSG3P32926 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSG3P32926 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSG3P32926 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSG3P32926 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSG3P32926 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSG3P32926 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSG3P32926 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSG3P32926 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSG3P32926 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSG3P32926 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSG3P32926 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSG3P32926 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSG3P32926 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSG3P32926 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSG3P32926 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSG3P32926 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSG3P32926 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSG3P32926 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSG3P32926 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSG3P32926 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSG3P32926 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSG3P32926 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DSG3P32926 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSG3P32926 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSG3P32926 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSG3P32926 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSG3P32926 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSG3P32926 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSG3P32926 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSG3P32926 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSG3P32926 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSG3P32926 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSG3P32926 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DSG3P32926 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSG3P32926 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSG3P32926 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSG3P32926 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSG3P32926 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSG3P32926 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSG3P32926 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms