Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCKBRP32239 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms