Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms