Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD40LGP29965 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms