Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP1P29466 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP1P29466 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP1P29466 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP1P29466 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP1P29466 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP1P29466 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP1P29466 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP1P29466 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP1P29466 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP1P29466 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP1P29466 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP1P29466 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP1P29466 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP1P29466 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP1P29466 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP1P29466 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP1P29466 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP1P29466 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP1P29466 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP1P29466 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP1P29466 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP1P29466 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP1P29466 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP1P29466 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP1P29466 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP1P29466 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP1P29466 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP1P29466 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP1P29466 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP1P29466 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP1P29466 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP1P29466 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP1P29466 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP1P29466 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP1P29466 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP1P29466 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP1P29466 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP1P29466 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP1P29466 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CASP1P29466 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASP1P29466 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASP1P29466 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CASP1P29466 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASP1P29466 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASP1P29466 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASP1P29466 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASP1P29466 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASP1P29466 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASP1P29466 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASP1P29466 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP1P29466 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP1P29466 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP1P29466 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP1P29466 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP1P29466 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP1P29466 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP1P29466 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP1P29466 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP1P29466 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP1P29466 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP1P29466 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP1P29466 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP1P29466 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP1P29466 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP1P29466 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP1P29466 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP1P29466 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP1P29466 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP1P29466 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP1P29466 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP1P29466 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP1P29466 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP1P29466 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP1P29466 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP1P29466 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP1P29466 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP1P29466 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP1P29466 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP1P29466 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP1P29466 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP1P29466 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP1P29466 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP1P29466 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP1P29466 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP1P29466 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP1P29466 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP1P29466 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP1P29466 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP1P29466 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP1P29466 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP1P29466 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP1P29466 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP1P29466 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP1P29466 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP1P29466 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP1P29466 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP1P29466 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP1P29466 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASP1P29466 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms