Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms