Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPREP23469 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPREP23469 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPREP23469 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPREP23469 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPREP23469 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPREP23469 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPREP23469 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPREP23469 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPREP23469 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPREP23469 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPREP23469 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPREP23469 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPREP23469 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPREP23469 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPREP23469 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPREP23469 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPREP23469 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPREP23469 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPREP23469 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPREP23469 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPREP23469 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPREP23469 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPREP23469 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPREP23469 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPREP23469 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPREP23469 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPREP23469 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPREP23469 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPREP23469 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPREP23469 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPREP23469 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPREP23469 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPREP23469 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPREP23469 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPREP23469 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPREP23469 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPREP23469 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPREP23469 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPREP23469 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPREP23469 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPREP23469 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPREP23469 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPREP23469 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPREP23469 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPREP23469 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPREP23469 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPREP23469 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPREP23469 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPREP23469 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPREP23469 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPREP23469 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPREP23469 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPREP23469 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPREP23469 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPREP23469 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPREP23469 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPREP23469 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPREP23469 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPREP23469 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPREP23469 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPREP23469 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPREP23469 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPREP23469 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPREP23469 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPREP23469 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPREP23469 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPREP23469 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPREP23469 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPREP23469 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPREP23469 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPREP23469 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPREP23469 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPREP23469 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPREP23469 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPREP23469 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPREP23469 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPREP23469 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPREP23469 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPREP23469 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPREP23469 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPREP23469 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPREP23469 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPREP23469 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPREP23469 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPREP23469 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPREP23469 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPREP23469 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPREP23469 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPREP23469 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPREP23469 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPREP23469 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPREP23469 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPREP23469 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPREP23469 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPREP23469 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPREP23469 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPREP23469 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPREP23469 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPREP23469 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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