Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GCSHP23434 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
GCSHP23434 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
GCSHP23434 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GCSHP23434 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
GCSHP23434 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GCSHP23434 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GCSHP23434 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.22
GCSHP23434 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
GCSHP23434 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
GCSHP23434 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCSHP23434 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCSHP23434 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCSHP23434 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCSHP23434 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCSHP23434 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCSHP23434 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCSHP23434 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCSHP23434 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCSHP23434 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCSHP23434 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCSHP23434 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCSHP23434 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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