Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYF6P23409 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYF6P23409 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYF6P23409 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYF6P23409 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYF6P23409 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYF6P23409 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYF6P23409 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYF6P23409 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYF6P23409 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYF6P23409 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYF6P23409 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYF6P23409 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYF6P23409 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYF6P23409 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MYF6P23409 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYF6P23409 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MYF6P23409 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MYF6P23409 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYF6P23409 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYF6P23409 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYF6P23409 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYF6P23409 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYF6P23409 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYF6P23409 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYF6P23409 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYF6P23409 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYF6P23409 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYF6P23409 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYF6P23409 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYF6P23409 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYF6P23409 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYF6P23409 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYF6P23409 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYF6P23409 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYF6P23409 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYF6P23409 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYF6P23409 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYF6P23409 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYF6P23409 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYF6P23409 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MYF6P23409 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYF6P23409 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYF6P23409 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYF6P23409 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYF6P23409 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYF6P23409 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYF6P23409 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYF6P23409 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYF6P23409 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYF6P23409 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MYF6P23409 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYF6P23409 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYF6P23409 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYF6P23409 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYF6P23409 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYF6P23409 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYF6P23409 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYF6P23409 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYF6P23409 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYF6P23409 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYF6P23409 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYF6P23409 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYF6P23409 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MYF6P23409 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYF6P23409 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYF6P23409 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYF6P23409 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYF6P23409 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYF6P23409 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYF6P23409 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYF6P23409 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYF6P23409 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYF6P23409 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MYF6P23409 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYF6P23409 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MYF6P23409 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYF6P23409 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYF6P23409 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYF6P23409 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYF6P23409 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYF6P23409 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYF6P23409 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYF6P23409 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYF6P23409 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYF6P23409 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYF6P23409 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYF6P23409 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYF6P23409 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYF6P23409 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYF6P23409 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYF6P23409 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYF6P23409 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYF6P23409 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYF6P23409 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYF6P23409 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYF6P23409 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYF6P23409 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MYF6P23409 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYF6P23409 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms