Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALB2P22676 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALB2P22676 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALB2P22676 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALB2P22676 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALB2P22676 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALB2P22676 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALB2P22676 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALB2P22676 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALB2P22676 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALB2P22676 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALB2P22676 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALB2P22676 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALB2P22676 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALB2P22676 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALB2P22676 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALB2P22676 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALB2P22676 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALB2P22676 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALB2P22676 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALB2P22676 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALB2P22676 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALB2P22676 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALB2P22676 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALB2P22676 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALB2P22676 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALB2P22676 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALB2P22676 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALB2P22676 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALB2P22676 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CALB2P22676 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALB2P22676 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALB2P22676 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALB2P22676 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALB2P22676 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALB2P22676 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALB2P22676 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALB2P22676 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALB2P22676 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CALB2P22676 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALB2P22676 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALB2P22676 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALB2P22676 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALB2P22676 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALB2P22676 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALB2P22676 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALB2P22676 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALB2P22676 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALB2P22676 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALB2P22676 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALB2P22676 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALB2P22676 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALB2P22676 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALB2P22676 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALB2P22676 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALB2P22676 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALB2P22676 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CALB2P22676 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CALB2P22676 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CALB2P22676 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CALB2P22676 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALB2P22676 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALB2P22676 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALB2P22676 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALB2P22676 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALB2P22676 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALB2P22676 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALB2P22676 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALB2P22676 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALB2P22676 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALB2P22676 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALB2P22676 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALB2P22676 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALB2P22676 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALB2P22676 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALB2P22676 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALB2P22676 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALB2P22676 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALB2P22676 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALB2P22676 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALB2P22676 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALB2P22676 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALB2P22676 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CALB2P22676 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALB2P22676 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALB2P22676 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALB2P22676 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALB2P22676 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALB2P22676 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALB2P22676 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALB2P22676 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALB2P22676 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALB2P22676 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALB2P22676 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALB2P22676 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALB2P22676 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALB2P22676 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALB2P22676 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALB2P22676 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CALB2P22676 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms