Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA1P20827 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms