Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCSHP14314 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRKCSHP14314 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRKCSHP14314 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PRKCSHP14314 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRKCSHP14314 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRKCSHP14314 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCSHP14314 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCSHP14314 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCSHP14314 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCSHP14314 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCSHP14314 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCSHP14314 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCSHP14314 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCSHP14314 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCSHP14314 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCSHP14314 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCSHP14314 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCSHP14314 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCSHP14314 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCSHP14314 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCSHP14314 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCSHP14314 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCSHP14314 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCSHP14314 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCSHP14314 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCSHP14314 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCSHP14314 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCSHP14314 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCSHP14314 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCSHP14314 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms