Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRF1P14222 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRF1P14222 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRF1P14222 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRF1P14222 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PRF1P14222 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRF1P14222 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PRF1P14222 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PRF1P14222 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PRF1P14222 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PRF1P14222 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PRF1P14222 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRF1P14222 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRF1P14222 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRF1P14222 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRF1P14222 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRF1P14222 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRF1P14222 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRF1P14222 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRF1P14222 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRF1P14222 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRF1P14222 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRF1P14222 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRF1P14222 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRF1P14222 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRF1P14222 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRF1P14222 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRF1P14222 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRF1P14222 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRF1P14222 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRF1P14222 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRF1P14222 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRF1P14222 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRF1P14222 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRF1P14222 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PRF1P14222 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRF1P14222 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRF1P14222 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRF1P14222 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRF1P14222 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRF1P14222 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRF1P14222 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PRF1P14222 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRF1P14222 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRF1P14222 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRF1P14222 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PRF1P14222 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRF1P14222 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRF1P14222 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRF1P14222 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRF1P14222 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRF1P14222 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRF1P14222 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRF1P14222 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PRF1P14222 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRF1P14222 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRF1P14222 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRF1P14222 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRF1P14222 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRF1P14222 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRF1P14222 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms