Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms