Protein–RNA interactions for Protein: P04216

THY1, Thy-1 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THY1P04216 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THY1P04216 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THY1P04216 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
THY1P04216 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THY1P04216 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THY1P04216 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
THY1P04216 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THY1P04216 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THY1P04216 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
THY1P04216 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
THY1P04216 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THY1P04216 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
THY1P04216 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
THY1P04216 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THY1P04216 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
THY1P04216 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
THY1P04216 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THY1P04216 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THY1P04216 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THY1P04216 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
THY1P04216 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THY1P04216 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
THY1P04216 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THY1P04216 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
THY1P04216 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THY1P04216 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
THY1P04216 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THY1P04216 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
THY1P04216 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THY1P04216 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THY1P04216 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
THY1P04216 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THY1P04216 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
THY1P04216 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
THY1P04216 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
THY1P04216 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
THY1P04216 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
THY1P04216 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
THY1P04216 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
THY1P04216 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
THY1P04216 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
THY1P04216 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
THY1P04216 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THY1P04216 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THY1P04216 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
THY1P04216 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THY1P04216 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THY1P04216 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
THY1P04216 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
THY1P04216 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THY1P04216 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THY1P04216 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THY1P04216 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THY1P04216 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THY1P04216 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
THY1P04216 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
THY1P04216 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
THY1P04216 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
THY1P04216 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
THY1P04216 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
THY1P04216 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
THY1P04216 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
THY1P04216 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
THY1P04216 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
THY1P04216 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
THY1P04216 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
THY1P04216 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
THY1P04216 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
THY1P04216 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
THY1P04216 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
THY1P04216 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
THY1P04216 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
THY1P04216 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
THY1P04216 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
THY1P04216 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
THY1P04216 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
THY1P04216 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
THY1P04216 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
THY1P04216 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
THY1P04216 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
THY1P04216 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
THY1P04216 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
THY1P04216 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
THY1P04216 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
THY1P04216 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
THY1P04216 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
THY1P04216 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
THY1P04216 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
THY1P04216 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
THY1P04216 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
THY1P04216 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
THY1P04216 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
THY1P04216 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
THY1P04216 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
THY1P04216 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
THY1P04216 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
THY1P04216 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
THY1P04216 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
THY1P04216 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
THY1P04216 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms