Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLIT2O94813 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLIT2O94813 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLIT2O94813 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLIT2O94813 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLIT2O94813 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLIT2O94813 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLIT2O94813 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLIT2O94813 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms