Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRMUO75648 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRMUO75648 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRMUO75648 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRMUO75648 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRMUO75648 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRMUO75648 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRMUO75648 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRMUO75648 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRMUO75648 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRMUO75648 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRMUO75648 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRMUO75648 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRMUO75648 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRMUO75648 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRMUO75648 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRMUO75648 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRMUO75648 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRMUO75648 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRMUO75648 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRMUO75648 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRMUO75648 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRMUO75648 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRMUO75648 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRMUO75648 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRMUO75648 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRMUO75648 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRMUO75648 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRMUO75648 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRMUO75648 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRMUO75648 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRMUO75648 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRMUO75648 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRMUO75648 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRMUO75648 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRMUO75648 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRMUO75648 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRMUO75648 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRMUO75648 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRMUO75648 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRMUO75648 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRMUO75648 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRMUO75648 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRMUO75648 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRMUO75648 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRMUO75648 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRMUO75648 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRMUO75648 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRMUO75648 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRMUO75648 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRMUO75648 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRMUO75648 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRMUO75648 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRMUO75648 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms