Protein–RNA interactions for Protein: O75581

LRP6, Low-density lipoprotein receptor-related protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP6O75581 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRP6O75581 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRP6O75581 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRP6O75581 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRP6O75581 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRP6O75581 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRP6O75581 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRP6O75581 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LRP6O75581 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRP6O75581 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRP6O75581 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRP6O75581 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRP6O75581 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRP6O75581 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRP6O75581 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRP6O75581 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRP6O75581 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
LRP6O75581 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRP6O75581 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRP6O75581 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRP6O75581 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRP6O75581 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRP6O75581 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRP6O75581 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRP6O75581 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRP6O75581 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRP6O75581 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRP6O75581 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRP6O75581 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRP6O75581 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRP6O75581 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRP6O75581 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LRP6O75581 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LRP6O75581 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LRP6O75581 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LRP6O75581 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP6O75581 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP6O75581 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP6O75581 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP6O75581 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP6O75581 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP6O75581 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP6O75581 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP6O75581 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP6O75581 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP6O75581 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP6O75581 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP6O75581 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP6O75581 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP6O75581 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP6O75581 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP6O75581 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP6O75581 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRP6O75581 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRP6O75581 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRP6O75581 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRP6O75581 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRP6O75581 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP6O75581 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP6O75581 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP6O75581 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP6O75581 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP6O75581 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP6O75581 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP6O75581 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP6O75581 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP6O75581 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP6O75581 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP6O75581 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP6O75581 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP6O75581 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP6O75581 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP6O75581 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP6O75581 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP6O75581 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP6O75581 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP6O75581 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP6O75581 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP6O75581 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP6O75581 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP6O75581 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP6O75581 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP6O75581 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP6O75581 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP6O75581 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP6O75581 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP6O75581 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP6O75581 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP6O75581 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP6O75581 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP6O75581 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP6O75581 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRP6O75581 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRP6O75581 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRP6O75581 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRP6O75581 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRP6O75581 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRP6O75581 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRP6O75581 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRP6O75581 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms